University of Heidelberg
BIOQUANT

04/01/2021 Open Position

The BMCV group currently offers a PhD position in biomedical image analysis.

More details can be...


01/27/2018 Cell Tracking Challenge, Nature Methods 2017

The cell tracking method of the BMCV group yielded top-ranking results in an international...


07/13/2015 ISBI 2016

Karl Rohr is program chair of the IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI) which...


11/10/2014 Project QuantVessel at Deutsche Bundestag (German Parliament)

The research project QuantVessel of the BMCV group is presented at an exhibition of the German...


11/10/2014 Excellent result at Particle Tracking Challenge, Nature Methods 2014

The Biomedical Computer Vision (BMCV) group successfully participated in an international...


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Sommersemester 2021

Projektseminar "Biomedizinische Bildanalyse"

Gebiet:

  Biomedizinische Bildanalyse

Umfang:

  4 SWS

Termin:

  Di, 15:00-18:00 Uhr, wöchentlich

Dauer:

  20.4. – 20.7.2021

Ort:

  Online (Infos siehe unten)

Dozent:

  PD Dr. Karl Rohr

Sprache:

  Deutsch oder Englisch

 

Inhalt:

Die Studierenden arbeiten in Teams an ausgewählten fortgeschrittenen Themen der Biomedizinischen Bildanalyse. Der Schwerpunkt liegt auf der automatischen Analyse von biologischen Mikroskopiebildern und medizinischen tomographischen Bildern. Beispiele für Themen  sind die Segmentierung und Verfolgung (Tracking) von Zellen in Mikroskopiebildern, die Segmentierung von Blutgefäßen in tomographischen Bildern sowie die Registrierung von multimodalen Bildern des menschlichen Gehirns. Beispiele für Bildanalysemethoden sind Maschinenlernverfahren und Methoden der Künstlichen Intelligenz (Deep Learning). Die Veranstaltung besteht aus einem Seminarteil (Einarbeitung in die relevante Literatur, Erarbeitung der theoretischen Grundlagen, Vortragspräsentation) und einem Projektteil (Spezifikation eines Softwaresystems, Entwurf von Algorithmen und Implementierung von Bildanalyseverfahren, Test und Evaluierung der Verfahren, Präsentation der Ergebnisse). Die erfolgreiche Teilnahme an diesem Projektseminar kann Ausgangpunkt zu weiterführenden Masterarbeiten sein.

 

Infos zur Online Durchführung:

Das Projektseminar wird online durchgeführt. Interessierte Studierende melden sich vor dem ersten Termin über Moodle an (Fakultät für Biowissenschaften / Pharmazie und Molekulare Biotechnologie / Master: Projektseminar Biomedizinische Bildanalyse). Der Schlüssel zum Einschreiben ist MasterBioMed. Infos zur Durchführung der Online Meetings werden unter "Ankündigungen“ in Moodle mitgeteilt.

 

Voraussetzungen: Grundkenntnisse im Gebiet Bildverarbeitung (Computer Vision, Image Analysis) oder Maschinelles Lernen (Machine Learning, Pattern Recognition).

Zielgruppe: Studierende der Informatik, Mathematik oder Physik sowie der Molekularen Biotechnologie (MSc Informatik: 6 CP, MSc MoBi: 8 CP oder 4CP).

Erster Termin: Di, 20.4.2021, 15:00 s.t.  

Kontakt: PD Dr. Karl Rohr (k.rohr{at}dkfz.de, k.rohr{at}uni-heidelberg.de)

 

 

Contact: E-Mail (Last update: 13/04/2021)