University of Heidelberg
BIOQUANT

04/01/2021 Open Position

The BMCV group currently offers a PhD position in biomedical image analysis.

More details can be...


01/27/2018 Cell Tracking Challenge, Nature Methods 2017

The cell tracking method of the BMCV group yielded top-ranking results in an international...


07/13/2015 ISBI 2016

Karl Rohr is program chair of the IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI) which...


11/10/2014 Project QuantVessel at Deutsche Bundestag (German Parliament)

The research project QuantVessel of the BMCV group is presented at an exhibition of the German...


11/10/2014 Excellent result at Particle Tracking Challenge, Nature Methods 2014

The Biomedical Computer Vision (BMCV) group successfully participated in an international...


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Sommersemester 2021

Seminar "Biomedizinische Bildanalyse: Deep Learning" (Blockseminar)

Gebiet:

  Biomedizinische Bildanalyse, Maschinenlernen

Umfang:

  4 ECTS

Termin:

  Blockveranstaltung, Termine in Absprache mit den Teilnehmern

Dauer:

  Mai/Juni/Juli 2021

Ort:

  Online (Infos siehe unten)

Dozent:

  PD Dr. Karl Rohr

Sprache:

  Deutsch oder Englisch

 

Inhalt:

Die Teilnehmer wählen einen wissenschaftlichen Artikel zu fortgeschrittenen Themen der Biomedizinischen Bildanalyse aus, halten einen Vortrag und erstellen eine schriftliche Ausarbeitung. Die Artikel befassen sich mit aktuellen Forschungsthemen und wurden in Fachzeitschriften oder bei internationalen Konferenzen publiziert.

Die Themen beschäftigen sich mit computerbasierten Methoden zur automatischen Analyse von biologischen Mikroskopiebildern und medizinischen Bilddaten. Der Schwerpunkt liegt auf Maschinenlernverfahren mit Deep Learning (z.B. Convolutional Neural Networks). Beispiele für Anwendungen sind die Segmentierung von Zellen, die Klassifikation histologischer Bilddaten, die Verfolgung (Tracking) von Zellen, die Segmentierung von Organen, und die Registrierung multimodaler Bilder.

Anmeldung und Vergabe der Themen in der Vorbesprechung am ersten Termin.

 

Infos zur Online Durchführung:

Das Seminar wird online durchgeführt. Interessierte Studierende melden sich vor dem ersten Termin über Moodle an (Fakultät für Biowissenschaften / Pharmazie und Molekulare Biotechnologie / Master: Seminar Biomedizinische Bildanalyse: Deep Learning). Der Schlüssel zum Einschreiben ist MasterDeep. Infos zur Durchführung der Online Meetings werden unter "Ankündigungen“ in Moodle mitgeteilt.

 

Voraussetzungen: Grundkenntnisse im Gebiet Bildverarbeitung (Computer Vision, Image Analysis) oder Maschinelles Lernen (Machine Learning, Pattern Recognition).

Zielgruppe: BSc und MSc Angewandte Informatik, MSc Molekulare Biotechnologie.

Erster Termin: Di, 20.4.2021, 13:00 s.t.   

Art der Veranstaltung: Seminar (IS)

Anforderungen: Modulhandbuch

Kontakt: PD Dr. Karl Rohr (k.rohr {at} dkfz.de, k.rohr {at} uni-heidelberg.de)

 

 

Contact: E-Mail (Last update: 13/04/2021)